Wonder Boy: The Dragon's Trap é um remake do Wonder Boy III: The Dragon's Trap original, com jogabilidade reversa projetada a partir do código original do Master System, apresentando novos gráficos desenhados à mão e rearranjos musicais. Situado imediatamente após os eventos de Wonder Boy em Monster Land, os jogadores controlam um aventureiro que, ao derrotar o Mecha Dragon, fica afligido por uma maldição que os transforma em um Homem-Lagarto. O jogador deve viajar pelo mundo e derrotar todos os outros dragões da terra para retornar à sua forma humana. Como no jogo original, os jogadores exploram vários terrenos, derrotando inimigos para ganhar itens, como flechas e bolas de fogo e dinheiro que pode ser usado para comprar novas armas e armaduras. Ao longo do jogo, o jogador ganha novas formas de animais, cada uma com novas habilidades, permitindo uma exploração adicional. Isso inclui Lizard-Man, que pode cuspir fogo, Mouse-Man, que pode se agarrar a blocos com padrão quadriculado, Piranha-Man, que pode nadar debaixo de água, Lion-Man, que pode realizar um ataque de barra vertical, e Hawk-Man, quem pode voar pelo ar. O jogo mantém a jogabilidade e o design do nível do jogo original, embora com algumas melhorias, como troca instantânea de armas e remoção da necessidade de adquirir pedras de charme para comprar novos equipamentos. O jogo também suporta senhas do jogo original. Novos recursos adicionados ao remake incluem configurações adicionais de dificuldade, a opção de jogar como uma personagem feminina chamada Wonder Girl, áreas bônus ocultas e a capacidade de alternar independentemente os gráficos e o áudio entre o moderno e o retrô. estilos com opções adicionais para filtros visuais e áudio FM. Isso marca a primeira vez que o áudio FM foi disponibilizado oficialmente em um lançamento ocidental do jogo.